RNA干扰回复实验套餐
RNA干扰回复实验,主要是为了说明Off-target效应。
Off-target effects(脱靶效应)最早由Dharmacon科学家Jackson和他的同事们提出(Fedorov, Y., et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce Toxic Phenotype." RNA Accepted (2006).)他们给细胞转染特定基因的单条siRNA后运用全基因组芯片检测技术鉴定表达上调/下调1.5到3倍的靶基因数量。研究人员发现在这种情况下有大量的基因被非特异性的调控着。siRNA正义链和反义链与脱靶基因的互补水平有高有低,并且每条siRNA所引发的脱靶基因表达谱也不尽相同,反映了序列依靠性的脱靶效应。
简单来说,Off-target效应就是指干扰shRNA序列进入了microRNA途径,通过microRNA途径,其可以不受完全互补的限制而调控大量靶基因的表达。原本需要19~23nt的RNA序列完全互补才能发生干扰作用,而如果进入microRNA途径,只需要11~15nt互补就可以产生干扰效果,这使得siRNA可能与非靶基因结合而导致非靶基因沉默,造成脱靶。
如果脱靶干扰的部分基因,正好与目的基因位于同一信号通路中,或者与目的基因的生物学功能相似,那么,如果因脱靶而干扰了其它基因,亦会造成和目的基因受到干扰后相同的细胞表型改变。而实际上,可能选择的这条shRNA序列并没有对目的基因造成有效干扰,或者虽然干扰了目的基因,但是并不会引起预期的细胞表型改变。
基于以上原因,自从Off-target效应被发现并被研究者们广泛认同后,越来越多的杂志要求研究者们在投稿时需要有相应的对照来说明Off-target效应。即您需要有相关对照或者实验来说明,您所获得的实验结果,不是由于Off-target效应而产生的。
而“RNA干扰回复实验套餐”,无疑是最佳的选择。
服务价格及周期(S4008):
| 项目 | 价格 | 周期 |
|---|---|---|
| 材料准备:质粒形式 | ||
| shRNA表达载体构建 | 1500元/条 | 2~3周 |
| 目的基因 | 1500~2000元 | 1周 |
| 目的基因过表达载体构建 | 1500~2000元 | 2~3周 |
| 定点突变 | 1500~2000元 | 2~3周 |
| 过表达NC对照 | 免费提供 | |
| 转染级质粒大提(100ug) | 200元/个 | 2~3天 |
| 材料准备:腺病毒形式 | ||
| 腺病毒包装 | 5000元/个 (滴度为109pfu/ml左右) | 4~5周 |
| 过表达NC腺病毒对照 (一般为rAd-EGFP) | 1000元 (滴度为109pfu/ml左右) | 1~2周 |
| RNA干扰回复实验 | ||
| 细胞培养 | 根据细胞类型而定, 150~300元/瓶 | 1周 |
| 细胞转染 | 50元/瓶 | 2~3天 |
| 腺病毒感染 | 免费 | 2~3天 |
| RT-PCR检测 | 500元+200元/样本 | 1周 |
| Western-blot | 500元+200元/样本 (不包一抗,免费提供二抗) | 1~2周 |
| MTT | 1000元/株细胞 | 1周 |
| 流式细胞检测 | 300元/样本 | 1周 |
| 克隆形成实验 | 2000元/株细胞 | 1~2周 |
| 细胞小室实验 | 询价 | 1~2周 |
| 其它实验 | 询价 | |
(注:部分内容可选做。)
客户须知:
- 进行RNA干扰回复实验前,最好先通过预实验确定目的细胞的质粒转染效率。如目的细胞的质粒转染效率大于70%,则可采用质粒形式载体;如目的细胞的质粒转染效率低于70%,则建议采用腺病毒。如目的细胞的质粒转染效率低于70%,而客户坚持使用质粒形式的载体进行实验,则本公司不保证实验结果。
- Western-blot实验中,如一抗采用国产抗体,本公司不保证一定会获得正结果。
- 本公司保证所提供的实验数据真实、准确,但不保证实验结果一定符合客户预期。
- 默认分组为:空白细胞组、RNA干扰组、RNA干扰+过表达(MT)组、RNA干扰+过表达NC组。如需加入RNA干扰NC对照,相应实验费用另外计算。
